PMPC sasniedz nozīmīgu pavērsienu – ieviesta Kinesa genomisko datu analīzei Google Cloud vidē

Šis ir nozīmīgs solis PMPC digitālās pētniecības infrastruktūras attīstībā un ceļā uz precīzāku un savlaicīgāku pacientu aprūpi.

Kinesa nodrošina iespēju veikt lielu un sarežģītu genomisko datu kopu analīzi mērogojamā un drošā mākoņdatošanas vidē. Papildus lokālajiem skaitļošanas resursiem mākoņinfrastruktūra sniedz nepieciešamo elastību un jaudu, piemēram, liela apjoma analīzēm un situācijās, kad nepieciešami papildu skaitļošanas resursi. Tā paver arī jaunas iespējas standartizētu bioinformātikas rīku izmantošanai un starpinstitucionālai pētniecības sadarbībai.

Šī risinājuma ieviešana ir pirmais nozīmīgais solis, lai nākotnē izveidotu drošu un lietotājiem ērtu vidi retu slimību genomisko datu analīzei un kopīgai izmantošanai dažādās institūcijās. Tas ir īpaši būtiski precīzijas medicīnas attīstībai pediatrijā, kur kvalitatīva un savlaicīga genomiskās informācijas analīze var palīdzēt labāk izprast slimības un nākotnē sniegt būtisku atbalstu diagnostikas un ārstēšanas lēmumu pieņemšanā.

Nozīmīgu ieguldījumu šī milestone sasniegšanā devuši PMPC komandas speciālisti – informācijas sistēmu drošības administrators Jānis Rencis, bioinformātiķe Agnese Viluma un ģenētiķe Dace Enkure. Viņu darbs apvienoja drošas mākoņinfrastruktūras izveidi, bioinformātikas kompetenci un ģenētikas perspektīvu, lai izveidotu risinājumu, kas atbilst gan pētniecības, gan nākotnes klīniskās izmantošanas vajadzībām.

Šis rezultāts nebūtu iespējams arī bez ciešās sadarbības ar Prinses Máxima Center kolēģiem. Īpašs paldies Jayne Hehir-Kwa, Jasper van Dalum un Karlijn Cammel par ieguldīto darbu, zināšanām un atsaucību visā ieviešanas procesā. Šis sasniegums ir lielisks piemērs tam, kā starptautiska sadarbība un zināšanu pārnese var palīdzēt veidot jaunas tehnoloģiskās iespējas Latvijā.

Kinesa ieviešana ir tikai pirmais solis. Turpinājumā paredzēts nozīmīgs izstrādes un validācijas darbs, lai izveidotu robustus bioinformātikas analīzes procesus un nodrošinātu to uzticamu izmantošanu klīniskajā praksē. PMPC turpina veidot infrastruktūru, zināšanas un tehnoloģiskos risinājumus, kas nepieciešami precīzijas medicīnas attīstībai un tās sniegto iespēju tuvināšanai pacientiem.